（一）辦公室。負責機關日常運轉，承擔黨建、人事、扶貧、規劃、信息宣傳、法規、安全、保密、信訪、政務公開和對外合作交流等工作；承擔機關和直屬單位財務管理，對專項資金使用情況進行監督檢查，指導開展績效評估；建立健全內部審計機制，開展內部審計工作；擬訂全區醫療保障發展政策和計劃，協同做好醫療保障基金預、決算管理；承擔規范性文件的合法性審查，承擔行政執法監督、行政復議、行政應訴等工作。

（二）待遇保障科（醫藥服務管理科）。執行醫療保障籌資和待遇政策，建立醫療保障待遇調整和確定機制，完善城鄉醫保籌資機制，統籌城鄉醫療保障待遇標準；統籌推進多層次醫療保障體系建設，統籌城鄉醫療救助、城鄉居民大病保險和其他各項補充保險的管理工作；實施醫療保障關系轉移接續政策；組織實施長期護理保險制度和標準；執行基本醫保目錄和大病保險目錄及支付標準配套政策；執行定點醫藥機構醫保協議和支付管理、異地就醫管理辦法和結算政策；組織推進醫保支付方式改革；組織開展藥品、醫用耗材、醫療技術的經濟性評價。提高醫療保障統籌層次，組織實施醫療保障精準扶貧工作。

（三）基金監督科（醫藥價格科）。組織實施醫療保障基金監督管理辦法，建立健全統一的醫療保障基金安全防控機制，監督管理納入醫保支付范圍的醫療服務行為和醫療費用，組織開展打擊欺詐騙取醫療保障基金行為；加強醫療保障經辦內控機制建設，規范醫保經辦業務；建立健全醫療保障信用評價體系和信息披露制度；依法查處醫療保障領域違法違規行為。統籌推進全區統一規劃、統一標準的醫療保障信息化建設，建立健全醫療保障經辦服務平臺、異地就醫費用結算平臺、醫療保障基金智能監控平臺和醫療保障數據管理平臺，加強醫療保障數據集中、分析、運用和發布，對醫療保障基金實行實時動態監管。組織實施藥品、醫用耗材價格和醫療服務項目、醫療服務設施收費等政策；建立價格信息監測、成本調查和發布制度；組織實施藥品、醫用耗材的招標采購、配送及結算管理政策。